ریشه درخت محوری و عمودی است و تا عمق بیشتر از دو متر به صورت فعال در داخل خاک فرو میرود.
سیستم ریشه زائی عمقی درخت را قادر می سازد تا به اعماق خاک نفوذ کرده و از آب و مواد موجود در آن به خوبی تغذیه نماید و از این رو درختان پسته قابلیت سازش با دوره های طولانی خشکسالی را دارند. اما در صورتی از این درخت محصول اقتصادی بخواهید حتما باید نیاز ابی ۵ تا ۱۰هزار مترمکعب در سال در هکتار را برای ان تامین کنید.